Ручной сканер штрих-кодов наиболее востребован в торговом деле (именно для этих целей и были разработаны первые сканеры). С их помощью гораздо проще идентифицировать товар при инвентаризации, продаже, поступлении новых позиций на склад. Для более развернутого учета в магазинах могут разрабатываться системы внутренних штрих-кодов. Считанные данные обрабатываются учетным ПО, служат подспорьем для статистических исчислений, составления отчетов и пр.

Кроме розничной торговли ручной сканер штрихкодов применим в фармацевтике, медицине, в транспортных и логистических компаниях для маркировки багажа, грузов.